Следовательно, любая интерпретация мутаций мДНК, сохранившихся в нынешних популяциях, зависит от знания того, как менялся во времени размер их популяций и как это могло вести к исчезновению множества материнских линий родства. Случайные утраты за счет генного дрейфа фальсифицируют реконструируемое генеалогическое древо человеческой мДНК, в ветвлении которого уже не заметно следов многих прошлых расхождений. Каждая неучтенная ветвь — это мутация, не принимаемая во внимание при определении того, насколько давно жила Ева. Изменения размеров человеческих популяций были резкими. В некоторых областях Северного полушария они существенно падали из-за климатических колебаний в ледниковую эпоху. Археологические данные в Африки и Австралии говорят о том, что сходные сокращения популяций могли происходить и там. При этом резко усиливался дрейф генов с утратой различных типов мДНК.